2016年，中央财政安排江河湖库水系综合整治资金预算185亿元，截至6月中旬已全部拨付。其中，用于支持中小河流治理和重点县综合整治100亿元；用于支持全国抗旱规划新建小型水库53.61亿元；用于江河湖库水系连通项目30亿元；用于国家水资源监控能力建设（二期）项目1.39亿元。

财政部要求，各地要及时分解下达资金，加快预算执行进度，加强绩效目标管理，切实提高资金使用效益。